يبدأ كيس الرحم بالتكوّن حول الجنين في الأسبوع الخامس من الحمل، ويستطيع الطبيب رؤيته بوضوح في هذه الفترة من خلال فحص السونار، ويكون ظهور كيس الرحم في السونار هو الدليل الوحيد على حدوث حمل وفي كثير من الأحيان يظهر كيس الرحم فارغاً أثناء فحص السونار ولا يظهر الجنين بداخله إلا في الأسبوع الثامن من الحمل، يتخذ كيس الرحم شكل كروي في أسفل تجويف الرحم، ويستعين الأطباء بقياسات حجم كيس الرحم لتحديد عمر الجنين بالأسابيع، كما أنّ فحص الحمل المخبري فلا يقدم نتائج دقيقة بوجود حمل أو عدمه إلّا بعد تكون كيس الحمل.